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पोस्टग्रेएसक्यूएल 12:के-निकटतम पड़ोसी अंतरिक्ष विभाजन को लागू करना सामान्यीकृत खोज ट्री इंडेक्स

अनुक्रमण का मान

PostgreSQL एक साधारण रैखिक दूरी ऑपरेटर प्रदान करता है <-> (रैखिक दूरी)। हम इसका उपयोग किसी दिए गए स्थान के निकटतम बिंदुओं को खोजने के लिए करेंगे।

PostgreSQL एक साधारण रैखिक दूरी ऑपरेटर डेटा प्रदान करता है, और कोई अनुकूलन नहीं करता है और कोई अनुक्रमणिका नहीं है, हम निम्नलिखित निष्पादन योजना देखते हैं:

time psql -qtAc "
EXPLAIN (ANALYZE ON, BUFFERS ON)
SELECT name, location
FROM geonames
ORDER BY location <-> '(29.9691,-95.6972)'
LIMIT 5;
"  <-- closing quote
                                      QUERY PLAN
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Limit  (cost=418749.15..418749.73 rows=5 width=38) 
        (actual time=2553.970..2555.673 rows=5 loops=1)
  Buffers: shared hit=100 read=272836
  ->  Gather Merge  (cost=418749.15..1580358.21 rows=9955954 width=38) 
                    (actual time=2553.969..2555.669 rows=5 loops=1)
        Workers Planned: 2
        Workers Launched: 2
        Buffers: shared hit=100 read=272836
        ->  Sort  (cost=417749.12..430194.06 rows=4977977 width=38)
                 (actual time=2548.220..2548.221 rows=4 loops=3)
              Sort Key: ((location <-> '(29.9691,-95.6972)'::point))
              Sort Method: top-N heapsort  Memory: 25kB
              Worker 0:  Sort Method: top-N heapsort  Memory: 26kB
              Worker 1:  Sort Method: top-N heapsort  Memory: 25kB
              Buffers: shared hit=100 read=272836
              ->  Parallel Seq Scan on geonames  (cost=0.00..335066.71 rows=4977977 width=38) 
                                        (actual time=0.040..1637.884 rows=3982382 loops=3)
                    Buffers: shared hit=6 read=272836
Planning Time: 0.493 ms
Execution Time: 2555.737 ms

real    0m2.595s
user    0m0.011s
sys    0m0.015s

और यहां परिणाम हैं:(सभी अनुरोधों के लिए समान परिणाम, इसलिए हम उन्हें बाद में छोड़ देंगे।)

नाम स्थान
सरू (29.96911,-95.69717)
साइप्रेस पॉइंट बैपटिस्ट चर्च (29.9732,-95.6873)
सरू डाकघर (29.9743,-95.67953)
हॉट वेल (29.95689,-95.68189)
ड्राई क्रीक एयरपोर्ट (29.98571,-95.68597)

तो, 418749.73 ऑप्टिमाइज़र लागत को हराने के लिए है, और उस क्वेरी को निष्पादित करने में ढाई सेकंड (2555.673) का समय लगा। यह वास्तव में एक बहुत अच्छा परिणाम है, 11 मिलियन पंक्ति तालिका के विरुद्ध PostgreSQL का उपयोग बिना किसी अनुकूलन के। यही कारण है कि हमने एक बड़े डेटा सेट का चयन किया, क्योंकि 10 मिलियन से कम पंक्तियों के खिलाफ इंडेक्स का उपयोग करने में बहुत कम अंतर होगा। समानांतर अनुक्रमिक स्कैन शानदार हैं, लेकिन यह एक और लेख है।

जिस्ट इंडेक्स जोड़ना

हम जीआईएसटी इंडेक्स जोड़कर अनुकूलन प्रक्रिया शुरू करते हैं। क्योंकि हमारी उदाहरण क्वेरी में एक

. है
LIMIT

5 वस्तुओं का खंड, हमारे पास बहुत अधिक चयनात्मकता है। यह योजनाकार को एक इंडेक्स का उपयोग करने के लिए प्रोत्साहित करेगा, इसलिए हम एक ऐसा प्रदान करेंगे जो ज्यामिति डेटा के साथ काफी अच्छी तरह से काम करता है।

time psql -qtAc "CREATE INDEX idx_gist_geonames_location ON geonames USING gist(location);"

सूचकांक बनाने के कार्य में थोड़ा खर्च होता है।

CREATE INDEX
real    3m1.988s
user    0m0.011s
sys     0m0.014s

और फिर वही क्वेरी फिर से चलाएँ।

time psql -qtAc "
EXPLAIN (ANALYZE ON, BUFFERS ON)
SELECT name, location
FROM geonames
ORDER BY location <-> '(29.9691,-95.6972)'
LIMIT 5;
"
                                      QUERY PLAN
----------------------------------------------------------------------------------
Limit  (cost=0.42..1.16 rows=5 width=38) (actual time=0.797..0.881 rows=5 loops=1)
  Buffers: shared hit=5 read=15
  ->  Index Scan using idx_gist_geonames_location on geonames  
            (cost=0.42..1773715.32 rows=11947145 width=38) 
            (actual time=0.796..0.879 rows=5 loops=1)
        Order By: (location <-> '(29.9691,-95.6972)'::point)
        Buffers: shared hit=5 read=15
Planning Time: 0.768 ms
Execution Time: 0.939 ms

real    0m0.033s
user    0m0.011s
sys     0m0.013s

इस मामले में, हम कुछ बहुत नाटकीय सुधार देखते हैं। क्वेरी की अनुमानित लागत केवल 1.16 है! इसकी तुलना 418749.73 पर गैर-अनुकूलित क्वेरी की मूल लागत से करें। लिया गया वास्तविक समय .939 मिलीसेकंड (एक मिलीसेकंड का नौ दसवां हिस्सा) था, जो मूल क्वेरी के 2.5 सेकंड की तुलना में है। इस परिणाम ने योजना बनाने में कम समय लिया, नाटकीय रूप से बेहतर अनुमान प्राप्त किया, और परिमाण कम रनटाइम के लगभग 3 ऑर्डर लिए।

देखते हैं कि क्या हम बेहतर कर सकते हैं।

SP-GiST अनुक्रमणिका जोड़ना

time psql -qtAc "CREATE INDEX idx_spgist_geonames_location ON geonames USING spgist(location);"
CREATE INDEX 

real    1m25.205s
user    0m0.010s
sys        0m0.015s

और फिर हम वही क्वेरी फिर से चलाते हैं।

time psql -qtAc "
EXPLAIN (ANALYZE ON, BUFFERS ON)
SELECT name, location
FROM geonames
ORDER BY location <-> '(29.9691,-95.6972)'
LIMIT 5;
"
                                      QUERY PLAN
-----------------------------------------------------------------------------------
 Limit  (cost=0.42..1.09 rows=5 width=38) (actual time=0.066..0.323 rows=5 loops=1)
   Buffers: shared hit=47
   ->  Index Scan using idx_spgist_geonames_location on geonames  
            (cost=0.42..1598071.32 rows=11947145 width=38) 
            (actual time=0.065..0.320 rows=5 loops=1)
         Order By: (location <-> '(29.9691,-95.6972)'::point)
         Buffers: shared hit=47
 Planning Time: 0.122 ms
 Execution Time: 0.358 ms
(7 rows)

real    0m0.040s
user    0m0.011s
sys        0m0.015s

बहुत खूब! अब SP-GiST इंडेक्स का उपयोग करते हुए, क्वेरी की लागत केवल 1.09 है, और इसे .358 मिलीसेकंड (मिलीसेकंड का एक तिहाई) में निष्पादित किया जाता है।

आइए खुद इंडेक्स के बारे में कुछ चीजों की जांच करें, और देखें कि वे डिस्क पर एक दूसरे के साथ कैसे ढेर हो जाते हैं।

सूचकांक तुलना

indexname निर्माण समय अनुमान क्वेरी का समय अनुक्रमित करें योजना समय
अनइंडेक्स्ड 0S 418749.73 2555.673 0 .493
idx_gist_geonames_location 3M 1S 1.16 .939 ms 868 एमबी .786
idx_spgist_geonames_location 1M 25S 1.09 .358 ms 523 MB .122

निष्कर्ष

इसलिए, हम देखते हैं कि एसपी-जीआईएसटी निष्पादन में जीआईएसटी की गति से दोगुना है, योजना के लिए 8 गुना तेज है, और डिस्क पर आकार का लगभग 60% है। और (इस लेख के लिए प्रासंगिक) यह पोस्टग्रेएसक्यूएल 12 के रूप में केएनएन इंडेक्स खोज का भी समर्थन करता है। इस प्रकार के ऑपरेशन के लिए, हमारे पास एक स्पष्ट विजेता है।

परिशिष्ट

डेटा सेट करना

इस लेख के लिए, हम GeoNames Gazetteer द्वारा प्रदान किए गए डेटा का उपयोग करने जा रहे हैं।
यह कार्य Creative Commons Attribution 4.0 लाइसेंस के तहत लाइसेंस प्राप्त है
डेटा बिना वारंटी या किसी भी प्रतिनिधित्व के "जैसा है" प्रदान किया जाता है सटीकता, समयबद्धता या पूर्णता।

संरचना बनाएं

हम एक कार्यशील निर्देशिका और थोड़ा सा ईटीएल बनाकर प्रक्रिया शुरू करते हैं।

# change to our home directory
cd
mkdir spgist
cd spgist
# get the base data.  
# This file is 350MB.  It will unpack to 1.5GB
# It will expand to 2GB in PostgreSQL,
#    and then you will still need some room for indexes
#  All together, you will need about 
#  3GB of space for this exercise
#  for about 12M rows of data.

psql -qtAc "
CREATE TABLE IF NOT EXISTS geonames (
geonameid           integer primary key
,name               text 
,asciiname          text 
,alternatenames     text 
,latitude           numeric(13,5) 
,longitude          numeric(13,5)
,feature_class      text 
,feature_code       text 
,country            text 
,cc2                text 
,admin1             text 
,admin2             bigint 
,admin3             bigint 
,admin4             bigint 
,population         bigint 
,elevation          bigint 
,dem                bigint 
,timezone           text 
,modification date  );

COMMENT ON COLUMN geonames.geonameid          
 IS ' integer id of record in geonames database';
COMMENT ON COLUMN geonames.name               
 IS ' name of geographical point (utf8) varchar(200)';
COMMENT ON COLUMN geonames.asciiname          
 IS ' name of geographical point in plain ascii characters, varchar(200)';
COMMENT ON COLUMN geonames.alternatenames     
 IS ' alternatenames, comma separated, ascii names automatically transliterated, 
    convenience attribute from alternatename table, varchar(10000)';
COMMENT ON COLUMN geonames.latitude           
 IS ' latitude in decimal degrees (wgs84)';
COMMENT ON COLUMN geonames.longitude          
 IS ' longitude in decimal degrees (wgs84)';
COMMENT ON COLUMN geonames.feature_class      
 IS ' http://www.geonames.org/export/codes.html, char(1)';
COMMENT ON COLUMN geonames.feature_code       
 IS ' http://www.geonames.org/export/codes.html, varchar(10)';
COMMENT ON COLUMN geonames.country            
 IS ' ISO-3166 2-letter country code, 2 characters';
COMMENT ON COLUMN geonames.cc2                
 IS ' alternate country codes, comma separated, ISO-3166 2-letter country code, 
    200 characters';
COMMENT ON COLUMN geonames.admin1             
 IS ' fipscode (subject to change to iso code), see exceptions below, 
    see file admin1Codes.txt for display names of this code; varchar(20)';
COMMENT ON COLUMN geonames.admin2             
 IS ' code for the second administrative division, a county in the US, 
    see file admin2Codes.txt; varchar(80) ';
COMMENT ON COLUMN geonames.admin3             
 IS ' code for third level administrative division, varchar(20)';
COMMENT ON COLUMN geonames.admin4             
 IS ' code for fourth level administrative division, varchar(20)';
COMMENT ON COLUMN geonames.population         
 IS ' bigint (8 byte int) ';
COMMENT ON COLUMN geonames.elevation          
 IS ' in meters, integer';
COMMENT ON COLUMN geonames.dem                
 IS ' digital elevation model, srtm3 or gtopo30, average elevation of 3''x3'' 
    (ca 90mx90m) or 30''x30'' (ca 900mx900m) area in meters, integer. 
    srtm processed by cgiar/ciat.';
COMMENT ON COLUMN geonames.timezone           
 IS ' the iana timezone id (see file timeZone.txt) varchar(40)';
COMMENT ON COLUMN geonames.modification       
 IS ' date of last modification in yyyy-MM-dd format';
"  #<-- Don't forget the closing quote

ETL

wget http://download.geonames.org/export/dump/allCountries.zip
unzip allCountries.zip

# do this, and go get a coffee.  This took nearly an hour
#   there will be a few lines that fail, they don't really matter much
IFS=$'\n'

for line in $(<allCountries.txt)
do

    echo -n "$line" | 
        psql -qtAc
    "COPY geonames FROM STDIN WITH CSV DELIMITER E'\t';"
2> errors.txt
done

क्लीन अप और सेट अप करें

बाकी सब कुछ हम psql के अंदर से करते हैं:

psql
-- This command requires the installation
--  of postgis2 from your OS package manager.
-- For OS/X that was `port install postgresql12-postgis2`
-- it will be something similar on most platforms.
-- (e.g. apt-get install postgresql12-postgis2, 
--  yum -y install postgresql12-postgis2, etc.)
CREATE EXTENSION postgis;
CREATE EXTENSION postgis_topology;

ALTER TABLE geonames ADD COLUMN location point;

-- Go get another cup of coffee, this is going to rewrite the entire table with the new geo column.
UPDATE geonames SET location = ('(' || latitude || ', ' || longitude || ')')::point;

DELETE FROM geonames WHERE latitude IS NULL or longitude IS NULL;
-- DELETE 32   -- In my case, this ETL anomoly was too small
--  to bother fixing the records

-- Bloat removal from the update and delete operations
CLUSTER geonames USING geonames_pkey;

  1. Database
  2.   
  3. Mysql
  4.   
  5. Oracle
  6.   
  7. Sqlserver
  8.   
  9. PostgreSQL
  10.   
  11. Access
  12.   
  13. SQLite
  14.   
  15. MariaDB
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