मुझे भी यही समस्या थी और अंत में SET NOEXEC . का उपयोग करके इसे हल करने में कामयाब रहा .
IF not whatever
BEGIN
SET NOEXEC ON;
END
ALTER TABLE dbo.EMPLOYEE ADD COLUMN EMP_IS_ADMIN BIT NOT NULL
GO
UPDATE dbo.EMPLOYEE SET EMP_IS_ADMIN = whatever
SET NOEXEC OFF;