mysql-server (किसी भी संस्करण का) अन्य पैकेजों पर निर्भर करता है (आपके मामले में mysql-community-libs mysql-community-server)
जब इसे पुराने संस्करण के साथ पहली बार स्थापित किया जाता है तो यह सामान स्थापित होता है। जब आप mysql-server को "अनइंस्टॉल" करते हैं तो ये निर्भरताएँ नहीं हटाई जाती हैं।
जब आप नए संस्करण को स्थापित करने का प्रयास करते हैं और स्थापित करते हैं तो ये अभी भी मौजूदा पैकेज नए पैकेज के साथ विरोध करेंगे। इससे कोई फर्क नहीं पड़ता कि पैकेज में वास्तविक फाइलें हैं या नहीं, यह पैकेज है और यह इस बात की सूची है कि उस संघर्ष की क्या उम्मीद है।
अपनी समस्या को हल करने के लिए यह पता लगाएं कि mysql-server की निर्भरताएं क्या थीं और इंस्टॉल करने का प्रयास करने से पहले उन्हें अनइंस्टॉल कर दें।
यह जवाब https ://superuser.com/questions/294662/how-to-get-list-of-dependencies-of-non-installed-rpm-package यह पता लगाने में रुचि हो सकती है कि mysql- सर्वर किस पर निर्भर करता है