अंत में जवाब मिला जब पता चला कि एक अलग स्क्रिप्ट जिसे मैं सफलतापूर्वक कई बार चलाऊंगा वह अब काम नहीं कर रही थी।
मैंने अपने डेटाबेस में संयोजन को utf8_general_ci से utf8_bin में बदल दिया था। MySQLdb 1.2.3 में एक बग है जिसके कारण utf8_bin स्ट्रिंग्स को टेक्स्ट के रूप में पहचाना नहीं जा सकता है, इसलिए यूनिकोड रूपांतरण नहीं हो रहा है। यह MySQLdb 1.2.4 में तय किया गया था।
https://sourceforge.net/p/mysql-python/bugs/289/