आप बड़ी मुसीबत में हैं...
डिफ़ॉल्ट रूप से ibdata1 में तालिका का सारा डेटा होता है (और इसलिए खो जाता है)। यहां तक कि अगर आप इसे प्रति तालिका एक अलग फ़ाइल का उपयोग करने के लिए कॉन्फ़िगर करते हैं, तो सभी आंतरिक MySQL का डेटा उस फ़ाइल में संग्रहीत किया जाता है, और जहाँ तक मुझे पता है, इसे पुनर्स्थापित करने का कोई तरीका नहीं है।
वास्तव में आशा है कि आपके पास बैकअप होगा....