अपने PHP की मेमोरी लिमिट और स्क्रिप्ट टाइम बढ़ाएं, क्योंकि आप php सर्वर के जरिए mysql इंस्ट्रक्शन को एक्सीक्यूट कर रहे हैं।
इस संस्करण के लिए अपनी php.ini फ़ाइल देखें:
memory_limit
max_execution_time
लेकिन वैसे भी मैं इसे mysql क्लाइंट (टर्मिनल) के माध्यम से करूँगा, mysql doc की जाँच करें
LOAD DATA LOCAL INFILE '/path/to/your/csv/file/csv_file.csv' INTO TABLE database_name.table_name FIELDS TERMINATED BY ',' ENCLOSED BY '"' LINES TERMINATED BY '\n';
Mysql Documentation - Load Data Infile Syntax PHP Documentation - Ini core settings