दो इंजनों के विन्यास की जाँच करें। यह संभव है कि आपके InnoDB इंजन का कॉन्फिगरेशन आपकी खोजों के लिए MyISAM सेट अप की तुलना में अधिक कुशल हो।
एक प्रमुख कॉन्फ़िगरेशन मान innodb_buffer_pool_size है, जो वह जगह है जहां InnoDB डेटा को कैश करता है (और अनुक्रमित करता है, लेकिन आपके पास कोई अनुक्रमणिका नहीं है)।