PHPMyAdmin (या बल्कि PHP) प्रत्येक स्क्रीन के बाद डेटाबेस कनेक्शन बंद कर देता है। इस प्रकार आपकी अस्थायी तालिकाएँ गायब हो जाती हैं।
आप PHPMyAdmin में SQL क्वेरी बॉक्स में एकाधिक SQL कथन डाल सकते हैं; इसे एक ब्लॉक के रूप में निष्पादित किया जाना चाहिए और इस प्रकार अस्थायी तालिका को हटाया नहीं जाना चाहिए।