यह MYSQL_ATTR_MAX_BUFFER_SIZE था जो डिफ़ॉल्ट रूप से 1MB है।
इससे समस्या ठीक हो गई:
$pdo->setAttribute(PDO::MYSQL_ATTR_MAX_BUFFER_SIZE, 1024*1024*50); // 50 MB
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इससे समस्या ठीक हो गई:
$pdo->setAttribute(PDO::MYSQL_ATTR_MAX_BUFFER_SIZE, 1024*1024*50); // 50 MB