आप बस WHERE जोड़ सकते हैं UPDATE का खंड . ओरेकल डॉक्स में इसके बारे में अधिक जानकारी।
तो आपके मामले में यह इस तरह दिखना चाहिए:
...
WHEN MATCHED
THEN
UPDATE
SET tgt.column3= src.column3,
tgt.column4 = src.coulmn4
WHERE tgt.column3 IN (val1, val2)
WHEN NOT MATCHED
...
